MNE库应用:EEG脑电图频谱拓扑图在Python中的可视化
发布时间:2024-01-05 23:36:30
MNE是一个用于处理和分析脑电图(EEG)、脑磁图(MEG)和其他神经成像模态的Python库。它提供了一组功能强大的工具,使您能够加载、预处理和分析脑电图数据。
EEG脑电图频谱拓扑图是一种将EEG信号频谱在头表上可视化的方法。它可以帮助我们理解大脑活动在不同频率上的分布,并在研究脑电图数据时提供有价值的信息。
在Python中使用MNE库进行EEG脑电图频谱拓扑图的可视化非常简单。下面是一个使用MNE库绘制EEG频谱拓扑图的例子:
import mne
from mne.datasets import sample
# 加载示例数据
data_path = sample.data_path()
raw_fname = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_raw.fif'
raw = mne.io.read_raw_fif(raw_fname, preload=True)
# 设置Montage(头表)
montage = mne.channels.make_standard_montage('standard_1005')
# 应用头表到原始数据
raw.set_montage(montage)
# 应用标准的降噪滤波器
raw.filter(1, 30, fir_design='firwin')
# 创建事件
events = mne.find_events(raw, stim_channel='STI 014')
# 创建Epochs
event_id = {'auditory/left': 1, 'auditory/right': 2, 'visual/left': 3, 'visual/right': 4}
tmin, tmax = -0.2, 0.5
epochs = mne.Epochs(raw, events, event_id, tmin, tmax, proj=True, baseline=(None, 0), preload=True)
# 计算频谱
freqs = [8, 13, 18, 23]
n_cycles = 2.0
power = mne.time_frequency.compute_epochs_psd(epochs, fmin=min(freqs), fmax=max(freqs), n_cycles=n_cycles)
# 创建拓扑图
fig, axis = plt.subplots()
mne.viz.plot_topomap(power[0].mean(0), pos=epochs.info, axes=axis, show=True, contours=4)
上述代码中,我们首先加载示例的脑电图数据,并应用了一个标准的头表。然后,我们使用标准降噪滤波器对原始数据进行滤波处理。
接下来,我们创建了事件和Epochs对象,并选择感兴趣的频率范围。然后,我们计算了Epochs对象的频谱。最后,我们使用mne.viz.plot_topomap函数绘制了频谱拓扑图。
该函数将频率范围内的每个电极上的功率数据绘制在相应的位置上,并使用颜色编码来表示功率强度。您可以使用参数来自定义拓扑图的外观,例如添加等高线或更改颜色映射。
通过使用MNE库的这个简单例子,我们可以很容易地实现EEG脑电图频谱拓扑图的可视化。这种可视化技术为我们深入研究脑电图数据提供了一个强大的工具。
