MNE库应用:EEG脑电图时频图在Python中的可视化
发布时间:2024-01-05 23:33:51
MNE是Python中用于处理和分析脑电图(EEG)数据的强大库。它提供了许多功能,包括数据导入、预处理、特征提取和可视化。在本文中,我们将介绍如何使用MNE库来可视化EEG数据的时频图。
首先,我们需要安装和导入MNE库。你可以使用以下命令在Python中安装MNE库:
pip install mne
接下来,我们导入必要的库:
import mne import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt
我们将使用MNE提供的示例数据进行演示。示例数据包含一个包含脑电图信号的数组,以及与之相关的一些附加信息。以下是加载示例数据的代码:
data_path = mne.datasets.sample.data_path() raw_file = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_raw.fif' raw = mne.io.read_raw_fif(raw_file, preload=True) # 选择一个通道(脑电图信号) ch_name = 'EEG 25' raw.pick_channels([ch_name])
加载数据后,我们可以使用MNE库中的函数来可视化时频图。MNE提供了mne.time_frequency.tfr_morlet()函数来计算时频图,该函数基于小波变换方法。以下是生成并可视化时频图的代码:
# 设置时频分析参数 frequencies = np.logspace(1, 50, num=10, base=2) n_cycles = 2 # 计算时频图 power, itc = mne.time_frequency.tfr_morlet(raw, freqs=frequencies, n_cycles=n_cycles, return_itc=True) # 可视化时频图 power.plot([0], baseline=(None, 0), mode='logratio', title='Time-Frequency Map', show=True)
上述代码中,我们首先设置了时频分析的参数,包括要分析的频率范围和小波的周期数。然后,我们使用mne.time_frequency.tfr_morlet()函数计算时频图。最后,我们使用plot()函数将生成的时频图可视化出来。
在可视化时频图时,你还可以进行一些其他设置,例如设置基线(用于相对功率的计算)、设置绘图模式(如对数比例)等。
以上是使用MNE库在Python中可视化EEG脑电图时频图的一个例子。MNE库提供了许多其他功能,可以帮助你对脑电图数据进行更深入的分析和研究。你可以在MNE官方文档中找到更多关于MNE库的信息和例子。
