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使用Python的MNE库实现脑电图可视化功能

发布时间:2024-01-05 23:28:04

MNE是一个Python库,用于处理和可视化脑电图数据。它提供了一系列用于加载、处理和分析脑电图数据的函数和工具。

首先,我们需要安装MNE库。可以使用以下命令在终端中安装MNE库:

pip install mne

一旦安装完成,我们可以开始使用MNE库来可视化脑电图数据。

以下是一个简单的示例,演示如何使用MNE库加载和可视化脑电图数据。

import mne

# 加载脑电图数据
raw = mne.io.read_raw_edf('path/to/edf/file.edf', preload=True)

# 设置参考电极
raw.set_eeg_reference('average')

# 创建事件
event_id = {'Stimulus': 1, 'Response': 2}
events = mne.find_events(raw)

# 创建蒙特卡洛源解析对象
fwd = mne.make_forward_solution(raw.info, trans='path/to/trans/file.fif',
                                src='path/to/source/space/file.fif',
                                bem='path/to/bem/file.fif')

# 找到导引场
fwd = mne.pick_types_forward(fwd, meg=False, eeg=True)

# 计算源活动
inverse_operator = mne.minimum_norm.make_inverse_operator(raw.info, fwd, cov)

# 进行时间频率分析
freqs = mne.arange(7, 30, 2)
n_cycles = freqs / 3
power, itc = mne.time_frequency.tfr_morlet(raw, freqs=freqs,
                                           n_cycles=n_cycles, return_itc=True,
                                           decim=3, average=True)

# 绘制时间频率图谱
power.plot_joint(times=[0.5], title='Time-Frequency Map')

# 绘制源空间
mne.viz.plot_source_estimates(inverse_operator['src'], subject='sample',
                              subjects_dir='path/to/subjects/dir')

首先,我们使用mne.io.read_raw_edf函数加载EDF格式的脑电图数据。然后,我们使用set_eeg_reference函数设置参考电极。接下来,我们使用mne.find_events函数创建事件。然后,我们使用mne.make_forward_solution函数创建蒙特卡洛源解析对象。接着,我们使用mne.minimum_norm.make_inverse_operator函数计算源活动。然后,我们使用mne.time_frequency.tfr_morlet函数进行时间频率分析。最后,我们使用power.plot_joint函数绘制时间频率图谱,并使用mne.viz.plot_source_estimates函数绘制源空间。

通过以上示例,我们可以看到使用MNE库可以轻松地加载、处理和可视化脑电图数据。MNE库提供了强大的功能,可以满足各种脑电图数据处理和分析的需求。无论是初学者还是专业人士,都可以通过MNE库轻松地处理和可视化脑电图数据。