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使用MNE库在Python中绘制脑电图谱

发布时间:2024-01-05 23:30:08

脑电图谱是根据脑电信号的频谱特征绘制的图形,用于反映脑电信号在不同频率范围内的能量分布。MNE是一款用于脑电磁图数据处理的Python库,可以方便地加载、处理和可视化脑电磁图数据。下面将介绍如何使用MNE库在Python中绘制脑电图谱带的使用例子。

首先,需要安装MNE库。可以使用pip命令进行安装:

pip install mne

接下来,我们需要准备一份脑电磁图数据。MNE库提供了一些示例数据集,可以用来进行演示。以MNE库中自带的示例数据集"sample"为例,可以使用以下代码加载数据:

import mne

# 加载示例数据集
data_path = mne.datasets.sample.data_path()
raw_fname = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_filt-0-40_raw.fif'
raw = mne.io.read_raw_fif(raw_fname, preload=True)

接下来,我们可以对数据进行预处理,如滤波、降采样等操作。这里我们以滤波为例,使用MNE库提供的滤波函数进行滤波处理:

# 滤波处理
raw.filter(l_freq=0.5, h_freq=30)

然后,我们可以选择感兴趣的脑电图谱带进行计算和绘制。MNE库提供了plot_power_spectrogram函数用于绘制脑电图谱带。以下是一个使用plot_power_spectrogram函数绘制alpha波谱带的例子:

# 绘制alpha波谱带
events = mne.find_events(raw)
epoch = mne.Epochs(raw, events, tmin=-0.5, tmax=1.5, baseline=None)
epoch.pick_types(meg=False, eeg=True)  # 保留EEG通道
epoch.load_data()

# 计算alpha波谱带
frequencies = mne.channels.find_ch_alpha(epoch.info)
power, itc = mne.time_frequency.psd_welch(epoch, fmin=frequencies[0]-2,
                                          fmax=frequencies[0]+2,
                                          n_fft=2048)

# 绘制alpha波谱带
fig, ax = plt.subplots()
mne.viz.plot_power_spectrogram(power[0], frequencies, ax=ax)
ax.set_title('Alpha band power')
ax.set_xlabel('Frequency (Hz)')
ax.set_ylabel('Power')

plt.show()

在上述例子中,首先使用mne.find_events函数找到事件,然后使用mne.Epochs类对事件进行划分得到epoch数据。接着,使用mne.channels.find_ch_alpha函数计算alpha波的频率范围,然后使用mne.time_frequency.psd_welch函数计算alpha波的能量谱。最后,使用mne.viz.plot_power_spectrogram函数绘制alpha波的图谱。

除了绘制alpha波谱带外,还可以根据需要选择其他感兴趣的频带进行计算和绘制。例如,可以使用mne.channels.find_ch_broadband函数计算宽带能量、使用mne.channels.find_ch_beta函数计算beta波能量等。

综上所述,使用MNE库在Python中绘制脑电图谱带主要包括加载数据、预处理、计算指定频带的能量谱和绘制图形等步骤。通过这些步骤,可以方便地对脑电图谱带进行分析和可视化。