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使用MNE库进行脑电数据中的时空频谱分析与可视化

发布时间:2023-12-23 19:36:42

MNE(MNE-Python)是一个用于脑电数据分析的Python库,它提供了一系列功能强大的工具和方法。以下是一个使用MNE库进行脑电数据的时空频谱分析与可视化的例子。

首先,我们需要导入必要的库和模块:

import mne
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

接下来,我们需要加载脑电数据。MNE库支持常见的数据格式,例如EDF,BDF,FIF等。我们可以使用mne.io.read_raw_*函数加载数据,其中*可以是文件后缀名,例如EDF文件可以使用mne.io.read_raw_edf函数。这里假设我们已经加载了一个名为data.raw的EDF文件:

raw = mne.io.read_raw_edf('data.raw')

然后,我们可以对数据进行必要的预处理,例如滤波、去噪等。这里假设我们对数据进行0.1-40Hz的带通滤波:

raw.filter(0.1, 40)

接下来,我们可以选择感兴趣的脑电信号通道进行分析。我们可以使用raw.info属性查看数据的通道信息,然后选择感兴趣的通道。例如,我们可以选择名为Fz的通道进行分析:

channel_name = 'Fz'
picks = mne.pick_channels(raw.info['ch_names'], include=[channel_name])

接下来,我们可以使用raw.get_data()方法从数据中提取感兴趣通道的信号。这将返回一个时间-通道的数组,其中每个元素表示在给定时间点上感兴趣通道的电压值。

data = raw.get_data(picks=picks)[0]

然后,我们可以使用mne.time_frequency.tfr_morlet函数对数据进行时频分析。这个函数会返回一个时频矩阵,其中每个元素表示在给定时间-频率点上的功率值。

freqs = np.arange(1, 50, 1)
n_cycles = freqs / 2.
power = mne.time_frequency.tfr_morlet(raw, freqs=freqs, n_cycles=n_cycles, picks=picks, average=False)

最后,我们可以使用power.plot()方法将时频矩阵可视化。这将生成一个时频图,其中x轴表示时间,y轴表示频率,颜色表示功率值。

fig, ax = plt.subplots()
power.plot(picks=picks, axes=ax, show=True, colorbar=True, cmap='jet')
plt.title('Time-Frequency Analysis')
plt.xlabel('Time (s)')
plt.ylabel('Frequency (Hz)')
plt.show()

以上就是使用MNE库进行脑电数据时空频谱分析与可视化的例子。通过这个例子,我们可以了解如何使用MNE库加载脑电数据,对数据进行预处理,选择感兴趣的通道,进行时频分析,并将结果可视化。MNE库提供了更多的功能和方法,可以用于更复杂的数据分析和可视化。