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使用Python和MNE库进行脑电数据中的事件诱发响应分析

发布时间:2023-12-23 19:35:00

MNE是一个用于处理脑电数据(EEG)、脑磁数据(MEG)和神经影像数据(MRI)的Python库。它提供了丰富的功能用于预处理和分析脑电数据,包括数据加载、事件诱发和可视化等。

下面是一个使用Python和MNE库进行脑电数据中的事件诱发响应分析的示例:

首先,我们需要导入必要的库和模块:

import mne
from mne.datasets import sample
import matplotlib.pyplot as plt

然后,我们加载一个示例脑电数据集,并查看数据集的信息:

data_path = sample.data_path()
raw_fname = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_filt-0-40_raw.fif'
event_fname = data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_filt-0-40_raw-eve.fif'

raw = mne.io.read_raw_fif(raw_fname, preload=True)
events = mne.read_events(event_fname)

print(raw.info)

接下来,我们可以使用MNE库的mne.viz.plot_events函数可视化事件:

plt.subplots_adjust(0.12, 0.08, 0.96, 0.94, 0.2, 0.43)
mne.viz.plot_events(events, raw.info['sfreq'], raw.first_samp, show=True)

然后,我们可以根据指定的事件类型和事件窗口长度创建事件诱发响应(ER):

event_id = {'Auditory/Left': 1, 'Visual/Right': 2}
tmin = -0.2  # 起始时间(秒)
tmax = 0.5  # 结束时间(秒)

epochs = mne.Epochs(raw, events, event_id, tmin, tmax, preload=True)

现在,我们可以计算每个事件类型的平均脑电响应:

auditory_epochs = epochs['Auditory/Left']
visual_epochs = epochs['Visual/Right']

auditory_evoked = auditory_epochs.average()
visual_evoked = visual_epochs.average()

最后,我们可以使用MNE库的mne.viz.plot_compare_evokeds函数可视化事件诱发响应的差异:

mne.viz.plot_compare_evokeds([auditory_evoked, visual_evoked],
                             picks='eeg', combine='mean', ylim=(-15, 15))

以上示例演示了如何使用Python和MNE库进行脑电数据中的事件诱发响应分析。你可以根据你的数据和需求适当调整代码,并使用MNE库的其他功能进行更深入的分析和可视化操作。