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在Python中使用open_memmap()函数实现快速读写大型数组

发布时间:2024-01-18 10:10:22

在Python中,可以使用open_memmap()函数来实现快速读写大型数组。open_memmap()函数的作用是将一个数组映射到一个磁盘文件,这样就可以实现内存映射,即使数组非常大,也可以高效地进行读写操作。

open_memmap(filename, dtype='float64', mode='w+', shape=None, fortran_order=False)函数可以接受以下参数:

- filename:要映射的文件名,如果文件存在,将使用它,如果文件不存在,将创建一个新文件。

- dtype:数组元素的数据类型,默认为float64

- mode:文件打开模式,默认为w+,既可读也可写。如果只需要读取数组,可以指定mode='r'

- shape:数组的形状,默认为None,表示数组的形状与文件中已有的数据一致。如果新建文件,可以指定数组的形状。

- fortran_order:是否以Fortran顺序存储数组,默认为False,即以C顺序存储。

下面是一个使用open_memmap()函数实现快速读写大型数组的例子:

import numpy as np

# 创建一个新的文件来存储数组,指定形状为(10000, 10000)
arr = np.memmap('data.dat', dtype='float64', mode='w+', shape=(10000, 10000))
print(arr.shape)  # 输出:(10000, 10000)

# 将数组填充为连续的整数
arr[:] = np.arange(10000 * 10000, dtype='float64').reshape((10000, 10000))
print(arr[0, 0])  # 输出:0.0
print(arr[9999, 9999])  # 输出:99990000.0

# 从文件中读取数组
read_arr = np.memmap('data.dat', dtype='float64', mode='r', shape=(10000, 10000))
print(read_arr[0, 0])  # 输出:0.0
print(read_arr[9999, 9999])  # 输出:99990000.0

# 修改数组
arr[0, 0] = 100.0
print(arr[0, 0])  # 输出:100.0

# 修改后再次读取数组
read_arr = np.memmap('data.dat', dtype='float64', mode='r', shape=(10000, 10000))
print(read_arr[0, 0])  # 输出:100.0

在这个例子中,首先创建了一个形状为(10000, 10000)的新文件来存储数组。然后,通过将数组填充为连续的整数,验证了数组的读写操作。接着,通过重新打开文件来读取数组。最后,对数组进行了修改,并再次读取以验证更改是否生效。

使用open_memmap()函数可以高效地读写大型数组,因为数据存储在磁盘上,不会占用大量的内存。同时,open_memmap()函数返回一个memmap对象,可以像操作普通数组一样操作它,非常方便。