Python中的fcluster()函数:一种快速的层次聚类算法
发布时间:2024-01-14 20:38:46
fcluster()函数是Python中scipy库中的一个函数,用于执行快速的层次聚类算法。层次聚类是一种自上而下的聚类方法,它将数据集分成不断减少的簇,直到每个数据点都属于一个独立的簇。
fcluster()函数的语法:
fcluster(Z, t, criterion='inconsistent', depth=2, R=None, monocrit=None)
参数:
- Z:样本的链接矩阵(由linkage()函数生成)
- t:聚类的阈值。根据不同的criterion选项,可以表示距离、不纯度或高度的阈值。
- criterion:阈值的判定依据,可选项为'inconsistent'(默认)、'distance'、'maxclust'、'monocrit'、'maxclust_monocrit'等。
使用例子:
假设我们有一个包含100个二维坐标点的数据集,现在我们想要对其进行层次聚类。
首先,我们需要导入必要的库和函数:
from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram, fcluster import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np
然后,我们生成一个随机的二维数据集:
np.random.seed(0) X = np.random.randn(100, 2)
接下来,我们使用linkage()函数计算数据集的链接矩阵:
Z = linkage(X, 'ward')
然后,我们可以使用dendrogram()函数绘制聚类结果的树状图:
dendrogram(Z) plt.show()
树状图将显示数据点的聚类情况,横轴表示数据点,纵轴表示聚类的距离。
最后,我们可以使用fcluster()函数根据所选的阈值划分数据集:
clusters = fcluster(Z, 2.5, criterion='distance')
这将根据距离阈值2.5对数据集进行聚类,将距离小于等于2.5的数据点分到同一个簇中。
通过这些步骤,我们可以使用fcluster()函数对数据集进行快速的层次聚类,并得到每个数据点所属的簇。
