欢迎访问宙启技术站
智能推送

Python中的fcluster()函数:一种快速的层次聚类算法

发布时间:2024-01-14 20:38:46

fcluster()函数是Python中scipy库中的一个函数,用于执行快速的层次聚类算法。层次聚类是一种自上而下的聚类方法,它将数据集分成不断减少的簇,直到每个数据点都属于一个独立的簇。

fcluster()函数的语法:

fcluster(Z, t, criterion='inconsistent', depth=2, R=None, monocrit=None)

参数:

- Z:样本的链接矩阵(由linkage()函数生成)

- t:聚类的阈值。根据不同的criterion选项,可以表示距离、不纯度或高度的阈值。

- criterion:阈值的判定依据,可选项为'inconsistent'(默认)、'distance'、'maxclust'、'monocrit'、'maxclust_monocrit'等。

使用例子:

假设我们有一个包含100个二维坐标点的数据集,现在我们想要对其进行层次聚类。

首先,我们需要导入必要的库和函数:

from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram, fcluster
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

然后,我们生成一个随机的二维数据集:

np.random.seed(0)
X = np.random.randn(100, 2)

接下来,我们使用linkage()函数计算数据集的链接矩阵:

Z = linkage(X, 'ward')

然后,我们可以使用dendrogram()函数绘制聚类结果的树状图:

dendrogram(Z)
plt.show()

树状图将显示数据点的聚类情况,横轴表示数据点,纵轴表示聚类的距离。

最后,我们可以使用fcluster()函数根据所选的阈值划分数据集:

clusters = fcluster(Z, 2.5, criterion='distance')

这将根据距离阈值2.5对数据集进行聚类,将距离小于等于2.5的数据点分到同一个簇中。

通过这些步骤,我们可以使用fcluster()函数对数据集进行快速的层次聚类,并得到每个数据点所属的簇。