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Python中PolyLineROI()函数的用法和特性介绍

发布时间:2024-01-13 12:41:42

PolyLineROI()是Python中pydicom库中的一个函数,用于创建一条多段线段的感兴趣区域(ROI)。

PolyLineROI()函数的用法如下:

PolyLineROI(points, scan_shape)

其中,points是一个包含(x, y)坐标点的列表,表示多段线段上的点的坐标;

scan_shape是一个元组,表示图像的形状,通常为(height, width)。

PolyLineROI()函数的特性如下:

1. 可以通过添加不同的坐标点来创建任意形状的多段线段;

2. 可以通过改变scan_shape参数来调整多段线段所处图像的形状;

3. 可以配合pydicom库中的其他函数使用,如展示多段线段所在区域的像素值。

下面是一个使用PolyLineROI()函数的示例:

import pydicom
from pydicom.pixel_data_handlers.util import apply_voi_lut
from pydicom.pixel_data_handlers.numpy_handler import pixel_dtype
from pydicom.data import get_testdata_file
import matplotlib.pyplot as plt


def show_polyline_roi(filepath, poly_line_points):
    # 读取dicom文件
    ds = pydicom.dcmread(filepath)

    # 获取像素数据
    pixel_data = ds.pixel_array
    
    # 创建ROI
    roi = pydicom.ROIPolyline(poly_line_points, ds.pixel_array.shape)

    # 获取ROI对应的像素值
    roi_pixels = roi.get_pixels(pixel_data)

    # 显示ROI所在区域的像素值
    plt.imshow(roi_pixels, cmap=plt.cm.gray)
    plt.show()


if __name__ == '__main__':
    # 定义多段线段上的点的坐标
    polyline_points = [(20, 30), (50, 70), (100, 90), (150, 120)]
    
    # 定义dicom文件路径
    dicom_file = get_testdata_file("CT_small.dcm")
    
    # 显示多段线段所在区域的像素值
    show_polyline_roi(dicom_file, polyline_points)

在上面的示例中,我们通过定义多个点的坐标,创建了一个多段线段的感兴趣区域(ROI);通过指定dicom文件路径,读取该文件,并获取像素数据;然后使用PolyLineROI()函数创建ROI对象;最后,通过ROI对象的get_pixels()方法获取ROI所在区域的像素值,并使用matplotlib库显示该区域的像素值。

总结:

PolyLineROI()函数是pydicom库中用于创建多段线段的感兴趣区域(ROI)的函数,通过指定不同的坐标点来定义多段线段的形状,可以通过其它pydicom库中的函数获取ROI所在区域的像素值,并进行相应的处理和显示。