Python中PolyLineROI()函数的用法和特性介绍
发布时间:2024-01-13 12:41:42
PolyLineROI()是Python中pydicom库中的一个函数,用于创建一条多段线段的感兴趣区域(ROI)。
PolyLineROI()函数的用法如下:
PolyLineROI(points, scan_shape)
其中,points是一个包含(x, y)坐标点的列表,表示多段线段上的点的坐标;
scan_shape是一个元组,表示图像的形状,通常为(height, width)。
PolyLineROI()函数的特性如下:
1. 可以通过添加不同的坐标点来创建任意形状的多段线段;
2. 可以通过改变scan_shape参数来调整多段线段所处图像的形状;
3. 可以配合pydicom库中的其他函数使用,如展示多段线段所在区域的像素值。
下面是一个使用PolyLineROI()函数的示例:
import pydicom
from pydicom.pixel_data_handlers.util import apply_voi_lut
from pydicom.pixel_data_handlers.numpy_handler import pixel_dtype
from pydicom.data import get_testdata_file
import matplotlib.pyplot as plt
def show_polyline_roi(filepath, poly_line_points):
# 读取dicom文件
ds = pydicom.dcmread(filepath)
# 获取像素数据
pixel_data = ds.pixel_array
# 创建ROI
roi = pydicom.ROIPolyline(poly_line_points, ds.pixel_array.shape)
# 获取ROI对应的像素值
roi_pixels = roi.get_pixels(pixel_data)
# 显示ROI所在区域的像素值
plt.imshow(roi_pixels, cmap=plt.cm.gray)
plt.show()
if __name__ == '__main__':
# 定义多段线段上的点的坐标
polyline_points = [(20, 30), (50, 70), (100, 90), (150, 120)]
# 定义dicom文件路径
dicom_file = get_testdata_file("CT_small.dcm")
# 显示多段线段所在区域的像素值
show_polyline_roi(dicom_file, polyline_points)
在上面的示例中,我们通过定义多个点的坐标,创建了一个多段线段的感兴趣区域(ROI);通过指定dicom文件路径,读取该文件,并获取像素数据;然后使用PolyLineROI()函数创建ROI对象;最后,通过ROI对象的get_pixels()方法获取ROI所在区域的像素值,并使用matplotlib库显示该区域的像素值。
总结:
PolyLineROI()函数是pydicom库中用于创建多段线段的感兴趣区域(ROI)的函数,通过指定不同的坐标点来定义多段线段的形状,可以通过其它pydicom库中的函数获取ROI所在区域的像素值,并进行相应的处理和显示。
