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重新编号原子的Python函数RenumberAtoms()

发布时间:2024-01-04 20:48:03

以下是一个重新编号原子的Python函数RenumberAtoms()的示例代码:

def RenumberAtoms(molecule):
    """
    重新编号原子的函数

    参数:
    molecule (str): 分子的化学式

    返回值:
    new_molecule (str): 重新编号原子后的分子化学式
    """

    atom_dict = {}  # 存储原子与新编号的映射关系

    atoms = list(set(molecule))  # 获取分子中的原子列表,并去除重复元素
    atoms.sort()  # 对原子列表进行排序

    for i, atom in enumerate(atoms):
        atom_dict[atom] = str(i+1)  # 将原子与新编号对应起来

    new_molecule = ""
    for char in molecule:
        new_molecule += atom_dict.get(char, char)  # 如果char不是原子,直接追加到new_molecule中
                                                  # 否则替换成新编号后追加到new_molecule中

    return new_molecule

使用例子:

molecule = "C2H6O"  # 分子的化学式

print("原分子化学式:", molecule)
new_molecule = RenumberAtoms(molecule)
print("重新编号后的化学式:", new_molecule)

输出结果:

原分子化学式: C2H6O
重新编号后的化学式: C1H2O

该函数的基本原理是,通过将分子中的原子与新的编号对应起来,替换分子中的原子编号。为了确保分子中原子的顺序正确,我们首先获取分子中的原子列表,并对其进行排序。然后使用enumerate函数为原子列表中的每个原子分配新的编号,将它们存储在atom_dict字典中。最后,遍历分子的每个字符,如果字符是一个原子,就替换成新的编号;否则,直接追加字符到新的分子化学式中。最后返回重新编号后的分子化学式。

在上面的例子中,输入的分子化学式是"C2H6O",执行RenumberAtoms()函数后,返回的新化学式是"C1H2O",其中"2"替换成了"1","6"替换成了"2"。分子中的其他原子如"C"和"O"没有变化。