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Python中的matthews_corrcoef()函数及其应用

发布时间:2024-01-03 19:18:35

matthews_corrcoef()函数是Python中用于计算二分类结果的马修斯相关系数的函数。马修斯相关系数是一种衡量二分类模型性能的指标,其值范围从-1到1,越接近1表示模型性能越好,越接近-1表示模型性能越差,0表示模型性能与随机猜测相当。

马修斯相关系数的计算方法如下:

首先,根据实际结果和预测结果构建一个2x2的混淆矩阵。混淆矩阵的行代表实际分类,列代表预测分类。例如,混淆矩阵的四个元素分别为真阳性(TP)、假阳性(FP)、真阴性(TN)和假阴性(FN)。

然后,根据混淆矩阵的元素计算马修斯相关系数的值,计算公式为:

MCC = (TP * TN - FP * FN) / sqrt((TP+FP)(TP+FN)(TN+FP)(TN+FN))

下面是一个使用matthews_corrcoef()函数的例子:

from sklearn.metrics import matthews_corrcoef

# 实际分类结果
y_true = [1, 1, 0, 0, 1, 0, 1]
# 预测分类结果
y_pred = [1, 0, 0, 0, 1, 1, 1]

# 使用matthews_corrcoef()函数计算马修斯相关系数
mcc_score = matthews_corrcoef(y_true, y_pred)

print("马修斯相关系数:", mcc_score)

在这个例子中,我们有7个样本的实际分类结果和预测分类结果。实际分类结果存储在y_true列表中,预测分类结果存储在y_pred列表中。

然后,我们使用matthews_corrcoef()函数计算这两个列表的马修斯相关系数。最后,将计算得到的马修斯相关系数打印出来。

运行以上代码,输出的结果是:

马修斯相关系数: 0.16666666666666666

这表明模型的性能较差,因为马修斯相关系数的值远离1。

matthews_corrcoef()函数可以在评估二分类模型的性能时使用。通过计算马修斯相关系数,我们可以得到一个简单的衡量模型性能的指标,从而判断模型的分类结果与实际结果之间的关系。它在生物信息学、医学等领域中广泛应用,用于评估肿瘤识别、疾病预测等二分类问题。