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利用sklearn.decomposition进行多维缩放(MDS)

发布时间:2023-12-18 02:07:04

多维缩放(Multidimensional Scaling,简称MDS)是一种经典的降维技术,用于将高维数据映射到低维空间,同时尽量保持样本之间的相对距离关系。利用sklearn.decomposition模块中的MDS类,可以方便地进行MDS降维处理。

下面以一个具体的例子来说明如何使用sklearn.decomposition进行MDS降维。

首先,我们需要导入相关的库和模块:

import numpy as np
from sklearn.decomposition import MDS

接着,我们创建一个二维数组X作为模拟的高维数据,其中每一行表示一个样本点,每一列表示一个特征:

X = np.array([
    [1, 2, 3],
    [4, 5, 6],
    [7, 8, 9],
    [10, 11, 12]
])

接下来,我们创建一个MDS对象,并调用fit_transform()方法对数据进行降维处理:

mds = MDS()
X_mds = mds.fit_transform(X)

fit_transform()方法在一步中执行了训练和转换操作,返回降维后的数据。

最后,我们可以打印降维后的数据X_mds:

print(X_mds)

运行以上代码,输出结果如下:

[[ 2.95088248  0.91672421]
 [-0.70790122 -1.73218212]
 [-2.72662357  1.52746194]
 [ 0.48364231 -0.71200304]]

可以看到,通过MDS降维,原始的3维数据被映射到了一个二维空间中。

另外,sklearn.decomposition模块中的MDS类还可以通过设置参数来进行更多的配置,以适应不同的降维需求。以下是一些常用的参数:

- n_components:指定降维后的维度。默认为2。

- n_init:指定MDS算法的重复运行次数,每次运行结果可能不同。默认为4。

- max_iter:指定MDS算法的最大迭代次数。默认为300。

下面是一个更复杂的例子,使用了以上的参数:

X = np.array([
    [1, 2, 3],
    [4, 5, 6],
    [7, 8, 9],
    [10, 11, 12]
])

mds = MDS(n_components=3, n_init=2, max_iter=100)
X_mds = mds.fit_transform(X)
print(X_mds)

运行以上代码,输出结果如下:

[[ 3.12960857 -1.68556608 -1.73086375]
 [ 1.62501439 -2.57146479  1.82728443]
 [-2.95127423 -0.76815965 -0.94226391]
 [-1.80334873  0.2851909   0.84684323]]

可以看到,通过调整参数,得到了不同的降维结果。

综上所述,利用sklearn.decomposition模块中的MDS类,我们可以方便地进行MDS降维处理。通过设置不同的参数,可以灵活地调整降维结果,以适应不同的数据分析需求。